קורסים שאינם מקנים נקודות זכות
20932 סדנה בהדמיה מולקולרית1
2 נקודות זכות ברמה מתקדמת ללא אפשרות לכתיבת עבודה סמינריונית
שיוך: מדעים / מדעי הטבע והחיים / כימיה
תנאי קבלה: 36 נקודות זכות עבור קורסים קודמים במדעים, ובכללם כימיה כללית (או כימיה כללית א + כימיה כללית ב), כימיה אורגנית, וכן עמידה בדרישות האנגלית ובדרישות ההדרכה הביבליוגרפית בספרייה. ידע קודם דרוש: ביוכימיה א לכימאים, תרמודינמיקה (או תרמודינמיקה לפיסיקאים), חשבון דיפרנציאלי ואינטגרלי א (או חשבון אינפיניטסימלי 1), יסודות הפיסיקה א + יסודות הפיסיקה ב, יישומי מחשב ויסודות התכנות למדעים. ידע קודם מומלץ: פרקים בפיסיקה מודרנית, תורת הקוואנטים א, ביוכימיה א, סימטריה וכירליות, תורת הקוואנטים ב.
פיתוח הקורס: ד"ר ענבל טובי-ערד
קורס זה מהווה גרסה מצומצמת לקורס נושאים בכימיה חישובית (20910). הקורס עוסק בהדמיה מולקולרית בשיטות של מכניקה מולקולרית.
תהליך הלימוד
1) לימוד הרקע התאורטי של המכניקה המולקולרית באמצעות פרקים נבחרים מהספר:
Errol Lewars, Computational Chemistry – Introduction to the Theory and Applications of Molecular and Quantum Mechanics, 2nd ed., (Springer, 2011)
ומדריך למידה תואם.
2) התנסות אישית בחישובים בעזרת תוכנת MOE וביצוע פרויקט חישובי מצומצם.
נושאים אפשריים לפרויקט חישובי
-
אנליזת קונפורמרים של תרופות בפאזה הגזית ובנוכחות ממס;
-
ניתוח מבנה מולקולרי של מקטעי חלבון כתלות בזמן;
-
השפעת מתמירים על אנרגית הסיבוב סביב קשר כימי.
בקורס זה חמישה מפגשי חובה.
מספר המקומות בקורס מוגבל.
1 להשלכות על צבירת נ"ז בשל חפיפה עם קורס(ים) אחר(ים), ראו פירוט החפיפה.